La Junta de Extremadura puso en marcha sus relaciones de cooperación con Portugal a raíz de la firma, en 1992 y en 1994, respectivamente, de sendos Protocolos de Cooperación con las regiones portuguesas vecinas del Alentejo y Centro. En estos Protocolos se establecía una estructura de cooperación básica que permitió institucionalizar las relaciones transfronterizas.

EL GIT es un proyecto aprobado por el Programa Operativo de Cooperación Transfronteriza España-Portugal (POCTEP) y financiado por la UE a través del FEDER. Se estructura en tres núcleos, uno en Mérida, dependiente de la Junta de Extremadura, y los otros dos en Évora y Coimbra, tutelados, respectivamente, por las Comisiones de Coordinación y Desarrollo Regional de Alentejo y Centro. Las tres oficinas cuentan con presupuesto y personal propio y trabajan de modo coordinado para la consecución de sus fines.

1. Estimular todo tipo de relaciones y proyectos de cooperación entre Extremadura y Portugal, poniendo en contacto y asesorando a los actores de uno y otro lado de la frontera.

2. Coordinar, asesorar y prestar apoyo técnico y de secretariado a los grupos de trabajo de composición tripartita que operan en el marco de las estructuras diseñadas por los Protocolos de Cooperación.

3. Organizar directamente o prestar apoyo técnico y financiero para la realización de jornadas y seminarios sobre temas específicos, cursos de portugués, encuentros de empresarios, exposiciones artísticas y, en general, cualquier proyecto de interés para el cumplimiento de sus fines.

4. Promover y apoyar de manera especial la celebración de intercambios entre escolares portugueses y españoles, fomentando desde la primera infancia la convivencia entre los jóvenes como pieza fundamental para favorecer el conocimiento, entendimiento y respeto mutuo.

5. Editar y difundir publicaciones sobre temas que afecten a las relaciones entre Extremadura y Portugal.

El GIT extremeño tiene su sede en Mérida, capital de la Comunidad Autónoma de Extremadura, y depende directamente de Presidencia de la Junta de Extremadura. El GIT encauza buena parte de su actividad a través de dos convocatorias anuales de ayudas, una para la realización de cursos de portugués y otra para cualquier otro tipo de actividades, destinadas a apoyar financieramente los proyectos de cooperación concebidos por los ayuntamientos, los particulares y las asociaciones sin ánimo de lucro. El GIT organiza también directamente otros proyectos estratégicos o de carácter estructurante.